Abstract The most used management unit in fisheries is limited to the target species and their associated species. Because spatial components can facilitate the understanding of the human-environment relationship, the objective of this study was to adapt a methodology to regionalize and characterize social-ecological systems (SES) for assessment and management of small-scale fisheries of Campeche, Mexico. Eight regions of the fishing SES were identified with a combination of unique characteristics from the biophysical context, the catch volume and fishing effort, and the fleet dynamics.

Resumen La unidad de manejo más utilizada en pesquerías está limitada a las especies objetivo y sus especies asociadas. La finalidad de este estudio fue adecuar una metodología para regionalizar y caracterizar los sistemas socio-ecológicos (SSE) para la evaluación y el manejo de las pesquerías de pequeña escala del estado de Campeche, México, debido a que los componentes espaciales pueden facilitar el entendimiento de la relación humano-ambiente. Se identificaron ocho regiones del SSE pesquero con una combinación de características únicas a partir del contexto biofísico, el volumen de captura y esfuerzo pesquero, así como la dinámica de la flota.

Resumen Introducción: La composición florística de la Isla del Coco está relativamente bien estudiada, principalmente la de plantas fanerógamas. Otros organismos, como los líquenes, continúan poco estudiados. Objetivo: El propósito de este inventario es ampliar la documentación sobre las especies de líquenes presentes en la Isla del Coco, mediante la revisión de literatura y colecciones de herbario, así como de nuevas colectas, para facilitar el conocimiento de su diversidad. Métodos: Se confeccionó una lista de las colecciones depositadas en varios herbarios dentro y fuera de Costa Rica, se complementó con las referencias bibliográficas de trabajos previos y, adicionalmente, se realizó una gira de campo en noviembre 2017 para recolectar y fotografiar especímenes. Los nombres de las especies incluidas se adecuaron de acuerdo con la base de datos en línea Index Fungorum. Resultados: Se recopilaron 284 ejemplares para la Isla del Coco pertenecientes a 173 taxones diferentes (incluyendo 40 nuevos registros), de los cuales 25 se identificaron a nivel de género y 148 a nivel de especie. Los ejemplares están distribuidos en 23 familias y 66 géneros. Las familias mejor representadas son Graphidaceae (25 spp.), Pilocarpaceae (24 spp.) y la familia Collemataceae (macrolíquenes, 8spp.). Los géneros Porina (15 spp.) y Strigula (14 spp.) fueron los más diversos. De las 148 especies, la mayoría (52%) son de distribución pantropical (pero también con presencia en zonas templadas). Las especies neotropicales representaron un 34%, las cosmopolitas un 13% y, hasta donde se conoce, las endémicas un 1%. La colonización de la isla por líquenes se debe a diferentes factores de dispersión como el viento, la lluvia, la migración de aves y la actividad humana. Conclusión: A pesar de la adición de nuevos taxones a la lista, el conocimiento sobre la diversidad liquénica de la isla puede aumentar, ya que quedan muchas áreas por explorar.

Abstract Introduction: The floristic composition of Isla del Coco is relatively well known. While studies have been typically oriented to flowering plants, other organisms such as lichens remain understudied. Objective: The purpose of this inventory is to expand the documentation of lichen species found in Isla del Coco, by reviewing literature and herbarium collections, as well as new collections, to facilitate the understanding of the diversity of said organisms. Methods: A list of the collections deposited in several herbaria was prepared, complemented with the bibliographical references of previous works. In addition, a field trip to collect and photograph specimens was performed in November 2017. The names of the species were adapted according to the online database Index Fungorum. Results: A total of 284 specimens were studied, corresponding to 173 different taxa, including 40 new records. Twenty-five taxa were identified at the genus level and 148 at the species level. The specimens were distributed in 23 families and 66 genera. The best-represented families are Graphidaceae (37 spp.), Pilocarpaceae (34 spp.) and Collemataceae (8 spp.). Porina (17 spp.) and Strigula (14 spp.) were the most diverse genera. The majority (52%) of the 148 species have a pantropical distribution, 34% are Neotropical and 13% are cosmopolitan. Endemic (according to current knowledge) represent about 1% of the species. Conclusions: Despite the addition of new taxa to the list, this is far from reflecting the existing lichen diversity on the island, as there are still many areas to explore.

RESUMO Objetivo Originar insights proativos para melhorar o controle da tuberculose (TB) em áreas urbanas descrevendo as atividades de controle da TB em hospitais em cinco cidades na América Latina. Métodos Estudo descritivo das atividades de controle da TB em hospitais realizado em 2013–2015 com base em pesquisa transversal concebida pela Organização Pan-Americana da Saúde e conduzida na Cidade da Guatemala (Guatemala), Guarulhos (Brasil), Bogotá (Colômbia), Lima (Peru) e Assunção (Paraguai). Os dados foram analisados com o uso do teste qui-quadrado, teste exato de Fisher e teste de Mantel–Haenszel para razões de risco, conforme necessário (P < 0,05). Resultados Apesar de ter existido variação entre as cidades, a maioria dos hospitais (91,3%) realizou o teste de esfregaço de bacilos acidorresistentes para o diagnóstico de TB e dispunha de um processo de controle de qualidade (94,0%), seguiu os protocolos nacionais de TB (95%) e notificou casos de TB aos órgãos sanitários competentes (96%). Além disso, o tratamento de TB foi proporcionado gratuitamente quase como um todo (97,1%). Porém, somente 74,2% dos hospitais receberam supervisão dos programas locais ou nacionais de combate à TB; 52,8% acompanharam os desfechos dos encaminhamentos e 39,1% ofereceram tratamento de TB ambulatorial completo, sendo que 68,7% usaram o tratamento diretamente observado. Conclusões O estudo destacou os pontos fortes e os pontos fracos em áreas específicas das atividades de controle da TB em hospitais e ressaltou a importância e a complexidade de coordenar esforços entre hospitais públicos e privados e as diversas partes envolvidas. Os programas locais de combate à TB e as autoridades sanitárias devem se basear nestes resultados para melhorar a qualidade das ações relacionadas à TB nos hospitais em condições semelhantes.

ABSTRACT Objective To generate actionable insights for improving TB control in urban areas by describing the tuberculosis (TB) control activities of hospitals in five cities in Latin America. Methods A descriptive study of hospital-based TB control activities was conducted in 2013–2015 using a cross-sectional survey designed by the Pan American Health Organization and administered in Guatemala City, Guatemala; Guarulhos, Brazil; Bogotá, Colombia; Lima, Peru; and Asunción, Paraguay. Data were analyzed using Chi-squared, Fisher exact tests, and the Mantel–Haenszel test for Risk Ratios, as necessary (P < 0.05). Results While variation among cities existed, most hospitals (91.3%) conducted acid-fast bacilli smears for TB diagnosis and had a quality control process (94.0%), followed national TB guidelines (95%), and reported TB cases to the respective health authorities (96%). Additionally, TB treatment was offered free of charge almost universally (97.1%). However, only 74.2% of hospitals were supervised by the national or local TB programs; 52.8% followed up on the outcome of referrals; and 39.1% offered full ambulatory TB treatment, with 68.7% using Directly-Observed Therapy. Conclusion The study underscored strengths and weaknesses in specific areas for TB control activities in hospitals and highlighted the importance and complexity of coordinating efforts among private and public hospitals and the various stakeholders. Local TB programs and health authorities should use these results to enhance the quality of TB-related actions in hospitals in similar settings.

RESUMEN Objetivo Generar información utilizable para mejorar el control de la tuberculosis en las zonas urbanas describiendo las actividades hospitalarias de control de la tuberculosis de cinco ciudades de América Latina. Métodos Se realizó un estudio descriptivo de las actividades hospitalarias de control de la tuberculosis mediante una encuesta transversal formulada por la Organización Panamericana de la Salud y administrada entre el 2013 y el 2015 en Ciudad de Guatemala (Guatemala), Guarulhos (Brasil), Bogotá (Colombia), Lima (Perú) y Asunción (Paraguay). Los datos fueron analizados con la prueba de la ji al cuadrado, la prueba exacta de Fisher y la prueba de asociación de Mantel-Haenszel de las razones de riesgos, según fuera necesario (P < 0,05). Resultados Pese a la variación observada entre las ciudades, la mayor parte de los hospitales (91,3 %) realizan frotis de bacilos acidorresistentes para diagnosticar la tuberculosis y disponen de un proceso de control de la calidad (94,0 %), siguen las directrices nacionales respecto de la tuberculosis (95 %) y notifican los casos a las autoridades de salud respectivas (96 %). Además, casi todos ofrecen tratamiento antituberculoso gratuito (97,1 %). Sin embargo, solo el 74,2 % de los hospitales está supervisado por el programa nacional o local contra la tuberculosis; el 52,8 % hace el seguimiento de la evolución de los pacientes derivados; y el 39,1 % ofrece tratamiento antituberculoso plenamente ambulatorio a los pacientes, del cual el 68,7 % corresponde al tratamiento bajo observación directa. Conclusiones En el estudio se ponen de relieve las fortalezas y las debilidades de aspectos específicos de las actividades hospitalarias de control de la tuberculosis, así como la importancia y la complejidad que reviste coordinar los esfuerzos entre los hospitales privados y públicos y los diversos interesados directos. Los programas locales contra la tuberculosis y las autoridades de salud deben aprovechar estos resultados para mejorar la calidad de las actividades hospitalarias relacionadas con la tuberculosis en entornos similares.

Gastric (GC) and breast (BrC) cancer are two of the most common and deadly tumours. Different lines of evidence suggest a possible causative role of viral infections for both GC and BrC. Wide genome sequencing (WGS) technologies allow searching for viral agents in tissues of patients with cancer. These technologies have already contributed to establish virus-cancer associations as well as to discovery new tumour viruses. The objective of this study was to document possible associations of viral infection with GC and BrC in Mexican patients. In order to gain idea about cost effective conditions of experimental sequencing, we first carried out an in silico simulation of WGS. The next-generation-platform IlluminaGallx was then used to sequence GC and BrC tumour samples. While we did not find viral sequences in tissues from BrC patients, multiple reads matching Epstein-Barr virus (EBV) sequences were found in GC tissues. An end-point polymerase chain reaction confirmed an enrichment of EBV sequences in one of the GC samples sequenced, validating the next-generation sequencing-bioinformatics pipeline.

Background: Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) is a degenerative disorder that affects the pyramidal tract, producing progressive motor dysfunctions leading to paralysis. These patients can present with dysphagia, requiring nutritional support with a nasogastric tube or Percutaneous Endoscopic Gastrostomy (PEG). PEG is associated with increased survival rates. However, the timing of PEG placement remains a significant issue for clinicians. Objective: To analyse the characteristics of ALS patients at the moment of PEG placement and their progression. Methods and materials: Descriptive retrospective study including patients diagnosed with ALS and PEG who were assessed during the 2005-2014 period in our hospital. Nutritional parameters and respiratory function were assessed for all patients, as well as their progression. The data was analysed using SPSS15. Results: 37 patients were included (56.8% men, 43.2% women) with an average age of 60 at diagnosis, and an average age of 63.1 at PEG placement. 48.6% started with spinal affection and 51.4%, with bulbar affection. 43.2% of the patients received oral nutritional supplements prior to PEG placement for a mean period of 11.3 months. The mean forced vital capacity at diagnosis was 65.45±13.67%, with a negative progression up to 39.47±14.69% at the moment of PEG placement. 86.5% of patients required non-invasive positive-pressure ventilation. 86.5% presented with dysphagia, 64.9% with weight loss > 5-10% from their usual weight, 8.1% with low Body Mass Index, 27% with malnutrition and 73% with aworsened breathing function; therefore, 100% met the criteria for PEG placement according to our protocol. The period on enteral feeding was extended for 10.1 months with a mortality of 50% during the first 6 months from PEG placement. Conclusions: There is evidence of a 3-year delay between diagnosis and PEG placement, with a survival rate of 50% at 6 months from PEG insertion. Further studies are required to establish whether an earlier placement might increase survival rates.

Introducción: La Esclerosis Lateral Amiotrófica (ELA) es una enfermedad degenerativa neurológica con afectación de la vía piramidal, produciendo trastornos motores progresivos que evolucionan hasta la parálisis. Estos pacientes pueden asociar disfagia, precisando soporte nutricional a través de de sonda nasogástrica o Gastrostomía Endoscópica Percutánea (PEG). La PEG está asociada con aumento de la supervivencia, sin embargo la evidencia acerca del momento óptimo para su colocación es escasa. Objetivo: Analizar las características de los pacientes con ELA en el momento de colocación de la PEG y su evolución. Material y métodos: Estudio descriptivo retrospectivo. Se incluyeron pacientes con diagnóstico de ELA y PEG valorados durante los años 2005-2014 en nuestro hospital. Se analizaron parámetros nutricionales y respiratorios, y evolución de los pacientes. Los resultados se analizaron en el programa SPSS15. Resultados: 37 pacientes fueron incluidos (56,8% hombres, 43,2% mujeres) con una edad media al diagnóstico 60 años, y edad media de colocación de PEG de 63,1 años, el 48,6% debutó con afectación espinal y el 51,4%, con bulbar. El 43,2% de los pacientes recibieron suplementos previa colocación de PEG durante un promedio de 11,3 meses. La capacidad vital forzada (CVF) media al diagnóstico fue del 65,45±13,67%, evolucionando desfavorablemente hasta un 39,47±14,69% en el momento de colocación de la PEG. El 86,5% de los pacientes precisaron soporte respiratorio con ventilación mecánica no invasiva (VMNI). El 86,5% presentaron disfagia, el 64,9% pérdida de peso > 5-10% de su peso habitual, el 8,1% IMC bajo, el 27% parámetros bioquímicos de desnutrición y el 73% empeoramiento de función respiratoria, por tanto, el 100% cumplían criterios de colocación de PEG según nuestro protocolo. La duración de la nutrición enteral fue de 10,1 meses con una mortalidad del 50% en los primeros 6 meses de la colocación de la PEG. Conclusiones: Evidenciamos una demora de 3 años entre el diagnóstico y la colocación de la PEG, con una supervivencia del 50% a los 6 meses de la realización de la misma. Más estudios son necesarios para determinar si una colocación más precoz podría aumentar la supervivencia.

Background. Colonization and chronic infection with Helicobacter pylori is the major contributing factor to the development of gastric cancer. A large repertoire of adhesins has been described that contribute to the adaptation of bacteria to a specific gastric niche. As in other pathogenic bacteria, H. pylori biofilm formation is central to survival on unfavorable environments. Type IV pili or fimbriae are responsible for the adhesion of many pathogenic bacteria (e.g., Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa and Vibrio cholerae ) to various surfaces. The aim of this study was to identify and analyze genes that might encode proteins involved in the biogenesis of fimbriae on H. pylori and characterize their expression during biofilm formation. Methods. PSI BLAST, bioinformatics and molecular tools were used as well as the NCBI database search for sequences related to protein biogenesis of fimbriae. Multiple alignments were performed using the HMMer and T-COFFEE programs. The secondary structure prediction was performed with ANTHEPROT and the tertiary structures were predicted with the I-Tasser. Results. We identified two counterparts-jhp0257 and HP0272-from protein of Campylobacter rectus and PilN Xilella fastidiosa , which is part of the machinery of assembly type IV fimbria. Similarly, proteins jhp0887 and HP0953 show homology from peptide PilA level of P. aeruginosa , and the HP0953 protein is overexpressed during the formation of the biofilm. Conclusions. H. pylori possesses proteins homologous to fimbrial protein families, specifically PilN and PilA, which join type IV fimbriae in other bacteria. The latter has a higher expression level during the initial stage of the formation of biofilm.

Introducción. La colonización e infección crónica por Helicobacter pylori es el factor de mayor contribución al desarrollo de cáncer gástrico. Se ha descrito un gran repertorio de adhesinas que contribuyen a la adaptación específica de la bacteria al nicho gástrico y, para H. pylori , al igual que en otras bacterias patógenas, la formación de biopelícula es fundamental en la supervivencia a ambientes no favorables. Las fimbrias o pili tipo IV son responsables de la adhesión de diversas bacterias patógenas ( Escherichia coli , Pseudomonas aeruginosa y Vibrio cholerae) a distintas superficies. El objetivo de este trabajo fue identificar y analizar genes que pudieran codificar para proteínas involucradas en la biogénesis de fimbrias en H. pylori y caracterizar su expresión durante la formación de biopelícula. Métodos. Se emplearon herramientas bioinformáticas y moleculares, tales como la base de datos del NCBI para la búsqueda de secuencias de proteínas relacionadas con la biogénesis de fimbrias, así como la herramienta de PSI BLAST. Los alineamientos múltiples se realizaron con el programa T-COFFEE y HMMER. La predicción de las estructuras secundarias se realizó con ANTHEPROT y las estructuras terciarias se predijeron con el programa I-TASSER. Resultados. Se identificaron dos homólogos, jhp0257 y HP0272, de la proteína PilN de Campylobacter rectus y Xilella fastidiosa , la cual es parte de la maquinaria del ensamble de la fimbria tipo IV. Asimismo, las proteínas jhp0887 y HP0953 presentaron homología a nivel del péptido señal de PilA de P. aeruginosa , y la proteína HP0953 se sobreexpresó durante la formación de la biopelícula. Conclusiones. H. pylori posee proteínas homólogas a las proteínas de familias fimbriales, específicamente PilN y PilA, que ensamblan fimbria tipo IV en otras bacterias. Esta última tiene un nivel de expresión mayor durante la etapa inicial del proceso de formación de biopelícula.

Forty sausages (chorizos) of four types; two traditional (rural markets and local butchers) and two industrial (wholesale large-city markets and supermarkets) were analyzed for determining the quality of the elaboration process and of the commercialization that could affect sausage quality. Chorizos are raw sausage elaborated in most places in Mexico either by small producers or by food industries. The pH, water activity values, moisture, fat, protein, common salt and collagen contents and the fatty acid profile were determined. Additionally, morphological parameters, color and texture were assessed to complete the characterization. As expected, variations in the properties of chorizo depended on the type and origin.

Se analizaron cuarenta chorizos de cuatro tipos; dos tradicionales (de mercados rurales y carnicerías locales) y dos industriales (de centrales de abasto y supermercados) con el fin de determinar las condiciones técnicas de elaboración y comercialización de los chorizos que pueden afectar su calidad. El chorizo es un embutido crudo que se comercializa en prácticamente todo México y su elaboración se realiza tanto de modo artesanal como industrial. Se determinó el valor de pH, la actividad de agua, el contenido de humedad, grasa, proteína, cenizas, sal y colágeno, y el perfil de ácidos grasos. Se completó la caracterización analizando la morfología de los chorizos, así como el color y textura. Se encontró variación en las características de los chorizos, dependiendo principalmente del origen de los mismos.

Objective: To study the antiarrhythmic effect of remifentanil in experimental arrhythmias in dogs. Methods: We used dogs weighing 12 kg-18 kg anesthetized with 30 mg/kg sodium pen-tobarbital given intravenously. Ventricular arrhythmia, ventricular fibrillation and death were induced with digoxin (9 ug/kg/min). In another model, two types of arrhythmia were induced in the right atrium, one of them with aconitine crystals placed on the right atrium and the other was induced in the basement of the right atrium by electrical stimulation. The potential antiarrhythmic action of remifentanil was investigated in ventricular and atrial arrhythmias by the administration of an intravenous bolus after toxic signs were evident. Thus, two arrhythmias with different mechanisms were generated. Leads DM, unipolar left intraventricular and right atrial leads, and left ventricular pressure were used to record control tracings and tracings in presence of remifentanil, during ventricular arrhythmia. Results: Remifentanil abolished toxic effects of digoxin, it eliminated the A-V dissociation and ventricular extrasystoles, reverting to sinus rhythm in each case. Remifentanil extended the time to reach lethal doses from 63.25 ± 11.3 to 100 ± 11.8 min. These effects were blocked by naloxone (0.01 ug/kg) applied before remifentanil. In the two arrhythmias model, remifentanil suppressed both, ectopic focus and atrial flutter. Conclusions: Remifentanil elicits antiarrhythmic and cardioprotective effects in experimental ventricular arrhythmias induced by digoxin and in a model of two atrial arrhythmias induced by aconitine and by electrical stimulation.

Objetivo: Estudiar el efecto antiarrítmico del remifentanil en las arritmias experimentales en perros. Métodos: Se utilizaron perros con peso entre 12 kg y 18 kg, anestesiados con pen-tobarbital sódico 30 mg/kg por vía intravenosa. Se les administró digoxina (9 mg/kg/min) hasta inducir intoxicación, manifestada por arritmias ventriculares, disociación A-V, fibrilación ventricular y muerte. Por otra parte, se generó un foco ectopico en la aurícula derecha inducido por cristales de aconitina y en la orejuela derecha se generó un movimiento circular con estimulación, estableciendo el modelo de la doble arritmia El remifentanil (0.05 ug/kg) se aplicó en bolo intravenoso. Se registraron las derivaciones Dll, las unipolares del ventrículo izquierdo, aurícula derecha, orejuela derecha y se registró la presión intraventricular izquierda. Resultados: El remifentanil fue capaz de revertir los efectos tóxicos de la digoxina, eliminando la disociación A-V, las extrasístoles ventriculares multifocales, con reversión a ritmo sinusal en todos los casos. El remifentanil prolongó el tiempo de la dosis letal de 63.25 ± 11.3 min a 100 ±11.8 min. Estos efectos del remifentanil fueron bloqueados al administrar, previamente, naloxona. En el modelo de la doble arritmia auricular, el remifentanil eliminó el foco ectopico y el flutter auricular. Conclusiones: El remifentanil tiene un efecto antiarrítmico y cardioprotector en las arritmias experimentales en el perro.

A substituição da gordura animal ou toucinho é importante para melhorar a qualidade nutricional dos alimentos de origem animal. Tradicionalmente, os embutidos contêm quantidades relativamente elevadas de gorduras insaturadas, e a substituição parcial ou total com gordura vegetal ou óleo é desejável. O abacate é fonte de gordura vegetal como uma alternativa para este tipo de produto. A oxidação desta fruta é um dos problemas principais durante a industrialização. Neste trabalho foram adicionados dois inibidores de escurecimento enzimatico, ácido ascórbico e eritorbato do sódio, para determinar o efeito destes na cor das salsichas. As diferenças na luminosidade das amostras foram detectadas em relação ao controle, além da diminução deste mesmo parâmetro com o tempo de armazenamento. Nenhum efeito significativo foi detectado nos outros parâmetros da cor do produto terminado. O uso do eritorbato do sódio na elaboração da pasta do abacate reduziu seu escurecimento durante o armazenamento, sem nenhum efeito nos outros parâmetros da cor. A aceitação do produto por um grupo de consumidores foi favorável.

La sustitución de grasa animal es importante para mejorar la calidad nutricional de los alimentos de origen animal. Tradicionalmente, los embutidos contienen cantidades relativamente altas de grasas insaturadas, por lo que se ha buscado la sustitución parcial o total de estas con grasas o aceites de origen vegetal. El aprovechamiento del aguacate como fuente de grasa vegetal es una alternativa para este tipo de productos. La oxidación de este fruto es uno de los principales problemas durante la industrialización. En este trabajo se han añadido dos inhibidores del oscurecimiento enzimático, ácido ascórbico y eritorbato de sodio, para determinar el efecto de éstos sobre el color de salchichas de cerdo. Se han encontrado diferencias en la luminosidad de las muestras con respecto al tratamiento control, además de que este mismo parámetro se ha reducido con el tiempo de almacenamiento. No ha habido efecto significativo de los antioxidantes sobre las otras componentes del color. El uso de eritorbato de sodio en la elaboración de pasta de aguacate ha reducido el oscurecimiento de la pasta durante su congelación, sin afectar mayormente otros parámetros de color del producto terminado. La aceptación del producto por un grupo de consumidores ha sido aceptable.